Dans cet article, je vais vous donner une visite dans MyCatDNA, ci-dessous vous avez obtenu un lien pour les tests de commande et une courte introduction.
C'est un test très complet, mais il faudra un certain temps pour obtenir les réponses, alors assurez-vous de faire le test à temps, je le fais normalement presque directement lorsque je ramène le chaton à la maison ou décide qui rester.
Attendez et vous recevrez un test-kit, cela peut prendre un peu de temps.
Lorsque vous obtenez votre kit de test et que vous êtes prêt à faire le test sur le chat, lisez bien les instructions! sur le papier. N'oubliez pas d'activer d'abord votre test-kit et de Ecrire vers le bas de la
code d'activation
Faites le test (certaines associations exigent que vous obteniez le test vérifié par un vétérinaire dans ce cas, vous devez aller chez un vétérinaire avec votre kit de test afin qu'ils puissent faire le test et signer les papiers). Si vous n'en avez pas besoin, vous pouvez le faire vous-même, suivez simplement les instructions pour éviter la contamination.
Mettez les autocollants de code sur chacun des écouvillons pour les sceller et aussi un sur le papier, mettez tout dans l'enveloppe.
Envoyez-le au labo.
Attendez et vous recevrez un e-mail lorsque le laboratoire aura reçu votre test.
Après quelques semaines 3-6, vous recevrez un e-mail vous indiquant que vos résultats sont prêts.
Lorsque vous arrivez pour la première fois à l'un de vos chats, vous verrez un résumé Trois échantillons seront montrés ci-dessous avec de courtes descriptions, mais d'abord quelques configurations que vous devriez faire.
Si vous cliquez sur le nom de votre chat, vous obtiendrez un résumé du chat comme ci-dessous. Le cœur est le Breedertool et le chat entre 1 et 2 j'y reviendrai plus tard.
Gérez le partage, regardez l'image suivante pour plus d'informations détaillées sur celle-ci.
Imprimez un rapport, vous pouvez obtenir les résultats dans un PDF, que vous pouvez imprimer ou enregistrer sur votre ordinateur, c'est ce que vous devriez envoyer à PawPeds par exemple si vous aimez PK, SMA et HCM enregistré.
catsettings1
Lorsque vous obtenez vos premiers résultats, votre chat ne sera pas public.
Cochez cette case pour rendre les résultats de vos chats publics pour tous les utilisateurs.
catsettings2
C'est ce à quoi il ressemble lorsque vous entrez dans votre chat pour la première fois, si le chat est exempt de tout risque génétique.
mycatdnasummary1stpage2
mycatdnadisorder frontatrisk1
Troubles Lorsque vous arrivez à l'une des pages de votre chat et cliquez sur les troubles, vous verrez une liste mais aussi un carré en haut vous indiquant s'il y a des risques détectés.
Vous verrez les troubles pertinents pour votre race en haut, puis de nouveaux troubles découverts qui seront potentiellement un risque au sein de votre race, puis en bas un carré vert avec un signe plus à droite, si vous cliquez là, vous pouvez voir tous les troubles pertinents pour les autres races et le résultat pour votre chat, il ne devrait pas y avoir de surprises ici, mais il est bon que nous les obtenions, vous ne savez jamais.
Comme vous pouvez le voir ci-dessous, ce chat ne présente aucun risque pour l'un des troubles connus testés et, tout en bas, le carré vert pour les troubles pertinents pour d'autres races. Le vert n'est pas un risque détecté Orange signifie que le chat est un porteur
mycatdnasumdisorders1
mycatdnasumdisorders2
mycatdnadisordersatrisk2
Lorsque vous êtes dans la section des troubles et que vous voyez la liste des troubles, vous pouvez cliquer sur la ligne, lorsque vous voyez une flèche vers le bas à droite et qu'un peu plus d'informations se déplieront, vous verrez également un lien vers un document PDF contenant plus d'informations sur la maladie.
mycatdnadisorderpdf
Type de sang
Bloodtypenn
bloodtypenb
bloodtypebb En ce qui concerne le trouble, vous avez une flèche vers le bas à la bonne vue de la ligne avec le groupe sanguin, vous pouvez replier cette ligne afin d'en savoir plus sur le groupe sanguin.
sanguinfoldoutprocent
Statistiques de la race Maine Coon
N/N - Type A
79,30%
N/b - B Transporteur
20,10%
b/b - Type B
0,60% De chats entrés dans MyCatDNA (Le jour pour l'article = 333 chats testés)
Traits Il y a des recherches en cours pour beaucoup d'entre eux, alors peut-être que nous aurons un test à l'avenir. Certains des traits que nous ne pouvons pas tester sont: Argent Il y a encore certains traits qui ne peuvent pas encore être testés dans n'importe quel laboratoire, même si la recherche est en cours pour beaucoup d'entre eux.
Différents motifs, comme Classic Tabby, Mackerel, Spotted, Ticked et Wideband (or/ombrage/coquille)
Les tests auxquels nous pouvons obtenir des réponses sont les suivants: Couleur Locus B: Chocolat et cannelle Couleur Locus C: Coloration pointue et albinisme Couleur Locus A: Agouti et Charcoal Gants blancs de Birman Cats Couleur Locus E: Russet Couleur Locus E: Amber Couleur Locus D: Dilution (Bleu et Crème)
Color Dominant blanc et blanc Spotting (KIT-Gene)
Couleur du manteau
traitscoatcolor1
Type de manteau Comme vous pouvez le voir ci-dessous, il existe trois types de manteaux, mais aussi quatre types de cheveux longs différents.
Dans notre Maine Coon, nous voyons principalement M3 ou M4 parfois l'un de chacun et ainsi de suite.
Cheveux longs
M4
M3
M2
M1
Manteau bouclé à Selkirk Rex
Manteau bouclé chez les chats Rex de Cornouailles et d'Allemagne
Dans le Maine Coon, les statistiques entre les différents types de cheveux longs de la race. Le (N) que vous pouvez voir ne signifie pas que le chat a les cheveux courts, mais il semble y avoir des types de cheveux longs qui ne sont toujours pas couverts par le test.
M4/M4
35,20%
M3/M4
41,80%
M3/M3
18,40%
N/M4
2,10%
N/M3 2,50% De chats entrés dans MyCatDNA
(Le jour pour l'article = 333 chats testés)
traitscoattype1
Morphologie
Il y a aujourd'hui trois mutations qui sont testées, vous les verrez ci-dessous.
Bien que cela dépende de tous les autres chats testés avec MyCatDNA, chaque chat changera le résultat de tous les autres chats. Cela signifie également que si la majorité des chats proviennent des mêmes lignées et qu'un chat provient d'une lignée complètement différente, ce chat obtiendra une diveristy génétique beaucoup plus élevée que les autres chats, de sorte qu'il ne montre pas encore vraiment la vérité au sein de la race. Il le sera probablement si ou quand suffisamment de chats au sein de la race ont été testés et ajoutés.
Sinon, il sera vraiment difficile de contacter le propriétaire si un très bon match est découvert. Cela peut être un très bon outil pour tous les éleveurs. Ci-dessous une capture d'écran pour un de mes chats.
breedertool
Enfin, je veux revenir au début, vous vous souvenez du chat en haut, celui entre le partage et l'impression pdf. gérer1
Il suffit de cliquer sur le chat et de remplir l'adresse postale à la personne à qui vous voulez déplacer le chat, cliquez sur soumettre et c'est fait.
Le chat Maine coon est un chat en bonne santé en général, mais comme dans d'autres races de chats, il existe certaines maladies génétiques dont nous devrions être conscients.
Cardiomyopathie hypertrophique
La cardiomyopathie hypertrophique, HCM, est une maladie cardiaque qui survient chez plusieurs races de chats, y compris le Maine coon. Il se manifeste en épaississant les parois du cœur, provoquant des difficultés pour le sang de passer à travers le cœur. Par l'examen échographique, la maladie peut être détectée, mais il n'y a malheureusement pas de remède. Le chat meurt tôt ou tard d'une insuffisance cardiaque ou d'un caillot sanguin.
Comme la maladie est progressive, elle se développe souvent lorsque le chat a quelques années. Habituellement, HCM est détecté chez un chat à l'âge de 2-3 ans, mais il peut prendre plus de temps avant que la maladie se produise. C’est pourquoi il est si important de se rappeler qu’un test cardiaque lorsque le chat est très jeune ne garantit rien, le chat peut développer la maladie plus tard. Je vois souvent des chats avec un seul test HCM à environ 1 an.
La façon dont la maladie est héréditaire n'est pas encore découverte. Certaines sciences montrent qu'il s'agit d'un gène dominant avec une pénétration incomplète. Si c'est vrai, la science du futur le dira.
En effectuant des examens échographiques réguliers sur les chats du cheptel reproducteur, nous réduisons le risque que la prédisposition à la MCH se poursuive au fil des générations. Depuis janvier 2004, Maine Coon-katten dirige le programme de santé contre HCM. (Depuis quelques années, Pawpeds exécute toutes les tâches administratives).
Si vous possédez un chien, vous reconnaissez probablement la dénomination HD – Dysplasie de la hanche.
Ce défaut génétique est présent même chez les chats. Les éleveurs de Maine Coon du monde entier ont depuis de nombreuses années trouvé la MH dans la race et prennent des mesures pour minimiser la présence de la maladie.
Normales Hips
Hanches avec degré 3 – HD sévère
HD signifie un défaut sur les hanches de sorte que la balle de la hanche ne rentre pas directement dans la douille de la hanche. Sur la photo de droite, les balles de hanche sont presque complètement à l'extérieur des prises de hanche, ce qui est très peu profond. C'est le degré le plus sévère de la MH. Les chats atteints de MH légère peuvent vivre sans aucun problème, tandis que la MH grave peut signifier des difficultés pour le chat à se déplacer et aussi des douleurs et des inflammations dans l'articulation. Il est possible d'opérer un chat qui a beaucoup de problèmes avec sa MH et le résultat est presque toujours bon. La HD est classée sur une échelle allant de la normale au degré 3 (HD sévère). L'élevage au degré 1 est correct tant que l'autre partie a Normal sur les deux hanches.
En janvier 2000, l'association de race suédoise Maine Coon-katten a lancé un registre pour la MH afin de cartographier la présence de la MH. Les éleveurs responsables radiographient les chats au plus tôt à l'âge de 10 mois, mais avant la première accouplement et envoient les radiographies à Per Eksell pour examen. Per est un spécialiste de la région. Per envoie ensuite les résultats au registre HD.
Les résultats et les statistiques du programme de santé sont publiés régulièrement. Voici quelques exemples tirés du registre (2012):
Chats testés: 2988
Progéniture de parents, tous deux avec un hipstatus inconnu:
Progéniture de parents, tous deux avec un hipstatus normal connu:
Normale : 1902 (63.7%)
Ligne de démarcation: 127 (4.3%)
Degré 1: 571 (19.1%)
Degré 2: 295 (9.9%)
Degré 3: 93 (3.1%)
Normale : 650 (58.9%)
Ligne de démarcation: 43 (3.9%)
Degré 1: 221 (20.0%)
Degré 2: 139 (12.6%)
Degré 3: 50 (4.5%)
Normale : 454 (76.0%)
Ligne de démarcation: 22 (3.7%)
Degré 1: 82 (13.7%)
Degré 2: 32 (5.4%)
Degré 3: 7 (1.2%)
(Plus tôt, nous avions borderline, celui-ci est maintenant plus utilisé).
De nouvelles statistiques de 2019 sur le bas, vous pouvez voir les résultats du parent et la pile dans le diagramme est les résultats des descendants. Comme vous pouvez le voir si vous vous accouplez Normal-Normal environ 70% deviennent normaux, vous avez environ 20% ayant un ancien degré limite ou degré 1 et seulement environ 10% ont obtenu des degrés 2 ou 3. Alors que si vous regardez la pile où les parents sont de statut inconnu, quelque part autour de 55-58% deviennent normaux tandis qu'environ 25-28% quelque chose a obtenu un vieux degré borderline ou degré un et près de 20% ont obtenu le degré 2 ou 3.
La HD est, à notre connaissance, héritière récessive, polygénétique. Cela signifie que deux chats avec des hanches normales peuvent avoir une progéniture avec la MH et l'inverse autour de deux chats avec la MH pourrait en fait avoir une progéniture avec des hanches normales. Il est donc important de faire la radiographie sur chaque génération pour minimiser le risque de MH. Dans la société d'élevage de chiens, cet élevage sélectif a entraîné un plongeon drastique en présence de MH.
Il existe trois groupes sanguins chez les chats A, B et AB. Le groupe sanguin le plus commun est A, qui est dominant et est présent dans toutes les races. Le type de sang B est relativement commun chez certaines races.
Avons-nous vraiment besoin de groupe sanguin nos Maine Coons? Il y a quelques années, j'aurais dit non, absolument pas, cela ne sert à rien. MAIS alors le fait est qu'il a commencé à apparaître porteurs de type B comme il semble récemment beaucoup d'entre eux. Apparemment, une étude sur Turkish Van dit qu'il est préférable d'avoir des porteurs b alors que seulement A pour une raison quelconque.
Obtenir une femme de sang B est assez difficile, donc personnellement, mon opinion est d'essayer d'éviter que cela se produise.
Les groupes sanguins A, B, AB et aussi A(b) par ADN pourront s'ajouter à PawPed. Pour éviter les malentendus concernant les résultats du test sanguin (test sérologique) par rapport au test ADN, les alternatives internationales ci-dessous ont été ajoutées à Pawpeds.
N/N (pas porteur du groupe sanguin B)
A/A non porteur du groupe sanguin B
N/b (porteur du groupe sanguin B)
A/b porteur du groupe sanguin B
b/b (homozygote pour le groupe sanguin B) le chat a le type sanguin B
N = normal
Statistiques de 2010:
Type B
Type AB
Total testé
Coon du Maine
4%
0%
25
Statistiques de 2018 (Cats testés avec MyCatDNA):
Type B
Type N/b ou A/b
Total testé
Coon du Maine
0%
1,1%
37
(Ces statistiques ont été collectées avant que je teste ma femme qui est en fait du sang b, de sorte que le type B n'est plus complètement 0%)
Depuis 2018, Genoscoper a lancé un nouveau test ADN. En plus des tests réguliers sur HCM1, SMA et PK-def et les traits, ce test fournit quelque chose de très cool: un aperçu de la diversité génétique! Des milliers de gènes sont mesurés, ce qui aboutit à un pourcentage montrant la diversité génétique du chat. Ces informations sont stockées dans une base de données et sont accessibles via mycatdna.com. Vous pouvez tout lire sur ce test ADN dans cet article "MyCatDNA".
Une partie de cette base de données est rendue publique par les propriétaires des chats. Avec les profils publics de Maine Coons, j'ai pu faire un peu de recherche pour créer plus de perspicacité sur cette nouvelle diversité génétique de test (%) et comment elle se rapporte à nos indicateurs conventionnels.
Ce graphique ci-dessous montre la diversité génétique de la race Maine Coon, qui se situe entre 28 et 42%. La diversité génétique moyenne de la race est de 34,5% à ce stade (22-1-2020). Lorsque d'autres Maine Coons seront testés et ajoutés à cette base de données à l'avenir, la moyenne et la bande passante de la diversité génétique peuvent changer. Le graphique est basé sur la population A* (expliquée à la fin de cet article). Vous pouvez voir dans le graphique que la plupart des Maine Coons testés ont un score entre 32 et 39% de diversité génétique. Très peu de Maine Coons marquent dans les zones extérieures. La base de données contient des Maine Coons du monde entier, elle comprend des lignes New Foundation, des lignes de présentation, des outcross et des Maine Coons polydactyles. Une base de données Maine Coon assez diversifiée, qui nous donne une bonne image de la diversité de notre race.
Le Maine Coon a-t-il une diversité génétique saine?
Le Maine Coon est une race naturelle, on pourrait donc s'attendre à ce qu'il soit diversifié. Bien qu'il n'y ait pas beaucoup de nouveaux Maine Coons de la Fondation ajoutés à la race aujourd'hui, la race est toujours considérée comme diversifiée. La diversité dépend des lignées qui sont élevées avec. Certaines lignes sont moins diversifiées que d’autres, c’est pourquoi les tests sont une bonne chose.
Si vous avez un chat moins diversifié maintenant, ne paniquez pas! En utilisant le breedertool dans MyCatDNA, vous pouvez trouver des chats spécifiques qui proviennent de lignées non apparentées et peuvent améliorer la diversité génétique de votre future progéniture. Un chat à faible diversité génétique peut encore être génétiquement d'une grande importance pour la population si les gènes ne sont pas liés à la majorité de la race. Vous pouvez facilement l'améliorer en choisissant le bon partenaire pour les futurs accouplements et faire un saut énorme en seulement une ou quelques générations. Lorsque plus de chats sont ajoutés et mis en public, plus cet outil sera intéressant. Il peut aider un éleveur à améliorer la diversité génétique dans le cadre de son plan de sélection, en plus des indicateurs conventionnels tels que COI% (coefficient de consanguinité total) et Clones%. Il ajoute une nouvelle perspective intéressante d’informations que les éleveurs ne possédaient pas auparavant.
Comparer différentes races de chats
Lorsque vous jetez un coup d'œil à la race Maine Coon par rapport aux autres races de chats, vous pouvez voir qu'elle est assez bien classée au 6e rang (polydactyle) et au 8e rang (non poly). Comme prévu, les races naturelles sont plus diversifiées génétiquement que les races créées par les éleveurs. Notez que cela ne montre que la médiane (moyenne). Chaque race a sa propre bande passante, pour certaines races, la bande passante est vraiment petite et pour d’autres races, elle est très large.
Un chat domestique est-il en meilleure santé qu'un Maine Coon?
Aux Pays-Bas, une pensée commune est qu'une race mixte ou un chat domestique est en meilleure santé qu'un chat généalogique en raison de leur plus grande diversité génétique. Eh bien, la médiane d'un chat domestique est en effet un peu plus élevée que la médiane d'un Maine Coon. La bande passante d'un chat domestique est comprise entre 35-42% (illustrée ci-dessous en orange) et pour un Maine Coon entre 28-42% (illustrée ci-dessous en bleu). MAIS selon les objectifs des éleveurs et les lignées avec lesquelles l'éleveur travaille, il est certainement possible d'élever des Maine Coons qui ont au moins autant de diversité génétique qu'une race mixte ou un chat domestique. Maine Coons qui ont une diversité génétique supérieure à 35% ont atteint ce point. Il est évident qu’un éleveur travaillant avec des chats généalogiques connaît mieux les lignées et la qualité des gènes en termes de santé qu’un éleveur dont le chat est accidentellement tombé enceinte par un chat voisin dont nous ne savons rien. Ce qui peut faire le choix d'un Maine Coon généalogique encore plus sûr qu'un chat domestique dont l'histoire des ancêtres est inconnue et où aucun test de santé n'est effectué.
Comment pouvez-vous utiliser la diversité génétique dans votre programme d'élevage?
Quand j'ai appris ce test, ma première question était: Comment la diversité génétique se rapporte-t-elle aux niveaux de consanguinité? Vous vous attendez à voir une plus grande diversité génétique de chats qui ont de faibles niveaux de consanguinité. Mais est-ce vrai pour chaque chat? J'ai dû le découvrir en faisant des recherches sur le profils publics Maine Coon dans mycatdna.com. J'ai regardé les noms de pedigree dans la base de données Pawpedsdatabase afin de trouver des informations sur les niveaux de consanguinité et les clones. Ensuite, j'ai fait les graphiques pour visualiser la corrélation entre les indicateurs que nous utilisons:
COI total %
consanguinité sur 5 générations et 10 générations
les clones
Vous trouverez ci-dessous les résultats pour chaque indicateur et la corrélation avec la diversité génétique. Tous ces graphiques sont basés sur la population B*.
Diversité génétique corrélée à COI%
Voyons comment la diversité génétique se rapporte au coefficient de consanguinité total (COI%). Vous pouvez voir la ligne verte, montrant le COI moyen par rapport à la diversité génétique (%). Par exemple, un Maine Coon qui a une diversité génétique de 39% (ces résultats sont arrondis) a un COI moyen de 5%. Et un Maine Coon avec une diversité génétique de 31% a un COI moyen de 19%.
Le lignes jaunes et bleues afficher la bande passante où le COI% peut être à un niveau individuel. Il montre qu'il y a au moins un Maine Coon qui a une grande diversité génétique de 38% et a également un COI plus élevé que prévu: 15%. La ligne jaune montre également un résultat exceptionnel d'un chat qui a une faible diversité génétique de 30% et a un COI de 0%. Comment cela peut-il se produire? Un chat avec 0% de consanguinité n'existe pas, mais les (nouveaux) chats de la Fondation sont enregistrés en tant que tels, car nous ne connaissons pas leurs parents et leurs niveaux de consanguinité. Cela montre que probablement tous les chats de la New Foundation (COI 0%) ne sont pas génétiquement diversifiés. Mais ce test peut prouver s'ils le sont! Ce chat en particulier a probablement des parents apparentés (COI élevé), mais pourrait encore être très indépendant de la majorité des autres chats et apporter de nouveaux gènes à la population.
Le ligne pointillée noire spectacles Combien de Maine Coons entrent dans la catégorie de la diversité génétique. Les bords extérieurs n’ont pas autant de résultats de test pour tirer des conclusions fiables ici. Mais la tendance (ligne verte) est très visible. En d'autres termes, il existe une corrélation entre le COI et la diversité génétique, mais elle n'est pas aussi prévisible, car il existe des exceptions.
Vous pouvez faire des prédictions générales ici: Un Maine Coon avec un COI de 15% est susceptible d'avoir une diversité génétique inférieure à 35%, mais vous pouvez voir à partir de la ligne bleue que 38% est encore possible. Les Maine Coons qui ont des niveaux de consanguinité plus faibles que 10% auront probablement un niveau de diversité génétique compris entre 36,5 et 40,5%. Dans un pedigree à faible COI% de nos jours, souvent un ou plusieurs chats New Foundation sont responsables des faibles nombres. Mais la diversité génétique dépend du niveau de diversité génétique du chat New Foundation et de l'absence de lien entre ces gènes et les lignées avec lesquelles vous les mélangez. Ce test ajoute de nouvelles informations sur la diversité génétique de cette nouvelle lignée et s'il ajoute effectivement quelque chose de nouveau à la race.
Diversité génétique corrélée à la consanguinité et à la consanguinité
Nous avons donc examiné de plus près les niveaux totaux de COI, mais qu'en est-il des niveaux de consanguinité qui sont plus récents dans le pedigree? J’ai ajouté deux catégories ici. Le niveau de consanguinité en 5 générations, qui montre à quel point les chats ne regardent que les 5 dernières générations. Le deuxième est le lignage qui a été fait au cours des 10 dernières générations, combien d'ancêtres doubles y trouvez-vous? Bien qu'il n'y ait pas beaucoup d'exemples de consanguinité extrême dans la base de données pour en tirer de bonnes conclusions, vous pouvez toujours voir dans le tableau ci-dessous, que pour être du côté supérieur de la diversité génétique, il est sage de maintenir les niveaux de consanguinité des 10 dernières générations de vos futurs accouplements en dessous de 2% (résultats > 34%) ou préférablement en dessous de 1% (résultats > 37%). Cela étant dit, un Maine Coon avec un niveau de consanguinité de 10 générations de 6% peut encore avoir une diversité génétique de 38%. Les chances sont faibles, mais cela arrive. Je suppose que c'était le chat chanceux qui a hérité des parties non apparentées des parents apparentés.
Au cas où vous n’auriez pas déjà réalisé que la consanguinité n’est pas une bonne idée du point de vue de la santé, l’outil d’éleveur vous aide à visualiser les résultats lorsque vous envisagez d’accoupler des chats apparentés.
Exemple 1:
L’accouplement frère-sœur augmente le COI de 25 %. Que se passe-t-il avec la diversité génétique lorsque vous planifiez un tel accouplement (ce qui n'est pas recommandé)? Dans l'outil d'éleveur, vous pouvez faire correspondre le profil de Chelles de Macadamie (diversité génétique de 39,2%) avec son frère Lyon de Macadamie (diversité génétique de 37,8%). (Notez que le frère et la sœur ont une différence de 1,4%, ce qui montre que tous les frères et sœurs n'ont pas la même diversité génétique.) Leurs chatons devraient avoir une diversité génétique d'environ 29,7%. Une diminution de 8,8% de la diversité génétique. Vous ne les obtenez pas beaucoup plus bas que cela! Évidemment une très mauvaise idée.
Exemple 2:
L’accouplement des grands-parents et des petits-enfants augmente le COI de 12,5 %. Nous prenons le profil de Chelles de Macadamie (39,2%) à nouveau et cette fois nous allons sélectionner son grand-père Mirai de So Out Coon (38,5%). Les deux chats ont une très bonne diversité génétique. La diversité génétique attendue de leurs chatons sera d'environ 34,9%. Une diminution de près de 3,95% de la diversité génétique en une seule génération. Il semble un petit nombre et un petit pas, mais ne prenez pas quelques pour cent très à la légère. Il vous emmène directement de l'autre côté du graphique. Souvenez-vous la bande passante de la population de Maine Coon testée n'est que de 14% (entre 28-42%), donc une diminution de 3,95% signifie que vous perdrez 28% de leur diversité génétique en une seule étape!
Relations génétiques
Notez que la base de données mycatdna ne garde aucune trace des relations familiales. La prédiction de la diversité génétique pour la progéniture est purement basée sur la comparaison des génomes. Si la diversité génétique prédite est inférieure à celle des deux parents, cela signifie que leurs génomes sont pour la plupart les mêmes (et ils sont probablement liés).
Sur la carte des relations génétiques des résultats des tests, vous pouvez voir tous les chats de la race et comment ils se regroupent lorsque leurs génomes ont des similitudes. Pensez à ceci: quand vous avez un Maine Coon avec une grande diversité génétique, disons 40%, mais il est montré dans le graphique au milieu de l'amas bleu de points. Cela signifie que vous aurez du mal à trouver une bonne correspondance pour améliorer davantage la diversité génétique, car la plupart des autres chats sont proches du vôtre et partagent la plupart du même ADN. Vous devrez rechercher des lignées dans les zones extérieures pour trouver des correspondances sans rapport, pour continuer une grande diversité génétique pour les générations futures.
Étonnamment, le graphique ci-dessous montre que les poils longs domestiques et les chats mixtes Maine Coon sont tous dans le même groupe jaune. Montrer que leur ADN est différent de la race Maine Coon, mais dans cette catégorie de races mixtes, il n'y a pas beaucoup de diversité du tout.
Notez également que le Polydactyl Maine Coons (points roses) semble être très diversifié. Les polydactyles sont enregistrés comme une race distincte dans Mycatdna et a sa propre médiane de 35,9%, ce qui est 1,4% plus élevé qu'un non-poly Maine Coon (34,5%).
Diversité génétique corrélée aux clones
Comment la diversité génétique est-elle liée aux clones? Nous savons qu'un pourcentage élevé de clones signifie que vous avez beaucoup des mêmes ancêtres (clones et derrière eux le top 5). Lorsque vous ne connaissez pas les clones, s'il vous plaît lire plus à ce sujet dans mon article "L'influence des clones" d'abord.
Regardez le tableau ci-dessous. Lorsque vous reproduisez des chats transversaux en gardant les clones en dessous de 20%, les chats auront très probablement tous une diversité génétique supérieure à 36%. En moyenne, ils sont même supérieurs à 38%. Ce qui est une très bonne nouvelle et une preuve pour chaque éleveur d'outcross, que vous travaillez en effet sur une plus grande diversité génétique avec des lignées d'outcross. Bien sûr, vous le saviez déjà, mais il est bon d'avoir des preuves!
Sachant que le pourcentage moyen de clones est d'environ 35%, ce graphique montre que la majorité de ces chats sont sur le côté gauche du graphique, ayant une diversité génétique inférieure à 35%.
Je pense donc que nous pouvons dire qu'il existe une corrélation entre la diversité génétique et les clones. Ce qui me fascine, c'est la question de savoir pourquoi ces lignes sont plus courbes? Le graphique précédent du COI montrait une ligne plus droite. Je n'ai pas encore trouvé de réponse.
Diversité génétique par pays
C'est un tableau amusant, mais c'est aussi le tableau le moins fiable de tous. Étant donné que certains pays n’ont que très peu de chats testés, nous ne pouvons pas encore vraiment tirer de conclusions. Ce graphique montre uniquement les pays qui ont un minimum de 3 chats dans la base de données publique. Ce graphique est basé sur la population C*. Le pays où le chat est né (et où se trouve l'éleveur) est le pays où le chat est compté.
La ligne noire montre combien de chats il contient et vous obtenez ainsi une image plus fiable pour les pays qui ont plus de chats testés.
Comme prévu, les Maine Coons avec la plus grande diversité génétique se trouvent aux États-Unis, car les chats de la New Foundation qui apportent de nouveaux gènes viennent tous des États-Unis (ou CA). Mais vous pouvez voir qu'ils ont aussi beaucoup de chats avec une plus faible diversité génétique, ce qui est probablement causé par les éleveurs américains qui importent des chats moins diversifiés de l'étranger.
Vous pouvez également constater que la Suède réussit très bien à maintenir la diversité génétique à un niveau élevé. De tous les pays du côté gauche, la Russie se distingue avec une diversité génétique plus faible de 33% en moyenne. Au cours de mes recherches, j'ai remarqué que la plupart des chats russes qui figurent dans la base de données mycatdna appartiennent maintenant à des éleveurs américains, ce qui réduira probablement la diversité génétique dans leurs programmes d'élevage. Cela peut être vu dans les générations futures testées d'éleveurs américains.
Si vous sortez les pays qui ont moins de 12 chats testés, vous vous retrouvez avec le top 5 des pays qui ont le plus de chats testés dans mycatdna. Ce graphique est basé sur la population D*.
Conclusion
La diversité génétique s'avère être un nouvel indicateur prometteur. Puisque le hasard joue également un rôle dans la façon dont les gènes sont hérités par la progéniture, il est moins prévisible que les indicateurs habituels comme COI, Clones et Top5. Il pourrait être plus difficile de l'intégrer dans votre programme d'élevage. Avec de faibles niveaux de consanguinité, vous visez une plus grande diversité, mais avec ce test, vous saurez réellement la diversité génétique du chat. Ce test est factuel et donc plus fiable que les autres indicateurs, il a donc certainement beaucoup de valeur. Le site mycatdna nous donne la possibilité aux éleveurs de garder une trace de la santé génétique de la race entière.
Bien sûr, nous ne devons pas rester aveugles sur la diversité seule, mais la diversité ne signifie pas nécessairement que le chat a des gènes sains. Vous pourriez toujours vous retrouver avec un chat génétiquement diversifié qui a hérité des mauvais gènes qui gâchent les choses. En outre, les informations génétiques ne doivent jamais remplacer un test HCM/PKD par un écho, un test HD/PL ou d'autres contrôles de santé cliniques effectués par un vétérinaire ou un spécialiste. Ce test ADN n'est qu'une petite partie des tests de santé totaux qu'un éleveur est recommandé de faire pour un Maine Coon.
Mais je dois dire que je suis un fan de ce test et très enthousiaste quant à l'impact positif que l'outil d'élevage peut avoir à l'avenir, surtout quand plus de chats sont ajoutés. Il pourrait être amusant (ou effrayant, selon la direction qu'il prend) de suivre les tendances pour les années à venir.
Population et source
Sur le site web de mycatdna, j’ai pris toute la population de Maine Coons (polydactyle inclus) des chats publics. Il y a beaucoup plus de Maine Coons testés, mais leur profil ne peut pas être vu par moi, donc je ne pouvais travailler qu’avec les chats publics. Le 22 janvier 2020, la population de Maine Coons publics était de 288 résultats de test. De ces chats, j'ai vérifié leur pedigree dans la base de données Pawpeds pour rechercher des informations sur les COI, la consanguinité de 5, 10 générations et les Clones. J'ai trouvé 212 chats dans la base de données Pawpedsdatabase. De ces 212 chats, j'ai également noté leur pays de naissance. Pour les 76 chats qui n'ont pas été trouvés dans Pawpeds, leur profil mycatdna m'a donné des informations sur le pays de naissance.
* Populations utilisées indiquées dans les graphiques de cet article:
Population A: 288 Maine Coons Total public Maine Coon profils sur mycatdna.com au 22-01-2020 (polydactyle inclus)
Population B: 212 Maine Coons Population A moins les 76 chats qui n'ont pas pu être trouvés dans la base de données Pawpeds
Population C: 277 Maine Coons Population A moins les chats nés dans des pays où seulement un ou deux chats sont publiés
Population D: 221 Maine Coons Population A moins les chats nés dans les pays où moins de 12 chats sont publiés
Dépistage génétique révolutionnaire 
